Là một loại virus tương đối phức tạp, EBV vẫn chưa được hiểu đầy đủ. Các phòng thí nghiệm trên thế giới tiếp tục nghiên cứu virus và phát triển những cách mới để điều trị các căn bệnh do nó gây ra. Một cách phổ biến để nghiên cứu EBV trong ống nghiệm là sử dụng nhiễm sắc thể nhân tạo vi khuẩn.[31] Vi rút Epstein-Barr có thể được duy trì và thao tác trong phòng thí nghiệm với độ trễ liên tục. Mặc dù nhiều virus được cho là có mặt trong quá trình lây nhiễm các vật chủ tự nhiên, không có một hệ thống quản lý dễ dàng để nghiên cứu phần này của vòng đời virus. Các nghiên cứu về bộ gen của EBV đã có thể khám phá sự tái hoạt hóa của lytic và sự điều tiết của các virus episome tiềm ẩn.[32]